A administração da Escola de Música é composta pela direção (diretor, vice-diretor, diretores adjuntos e coordenadores de curso), pelos sete departamentos e pelos setores administrativos, a saber: gabinete do diretor, setor de atividades gerenciais, setor financeiro, setor de pessoal, setor artístico, setor de comunicação, setor de registro autoral, protocolo, núcleo de documentação arquivística, biblioteca, secretaria de graduação, secretaria de pós-graduação e secretaria de extensão..